微量元素的“归经”假说认为，微量元素是中药的有效成分之一，中药微量元素在体内的迁移、选择性富集及微量元素结合物对疾病部位的特异性亲和是中药归经的重要基础。Zn、Mn、Fe作为共同的物质基础，对神经-内分泌系统和免疫系统起到调节作用。对多种中药的微量元素与归经的关系进行统计分析，发现归肝经的中药富含Fe、Cu、Mn、Zn，明目类中药中富含Zn、Mn、Cu、Fe等微量元素，与眼组织中的Zn、Mn、Cu、Fe含量呈正相关，提示这些微量元素是中药发挥造血、保肝、保护视力作用的物质基础之一。补肾中药补骨脂、肉苁蓉、熟地*、菟丝子等含有较高的Zn、Mn络合物，Zn、Mn等微量元素与人类的生殖发育具有密切关系，并在性腺、肾上腺、甲状腺等部位富集；机体缺少Zn、Mn可以引起蛋白质、核酸代谢障碍，因此认为富含Zn、Mn是补肾中药归肾经的物质基础。
中药归经与现代受体学说有许多相似之处，均强调药物在机体内的选择性。药物小分子由于受结构、构象的限制，只能与特定受体结合而表现出相应的药理作用。受体是功能单位，又具有定位的特点，某种受体的分布可以跨器官、跨系统，这些与中医脏腑概念的特征极为相似，中药归经极有可能与其作用于某种或某几种受体有关。以受体学说来研究归经，可以在更深层次上揭示归经机理，也可以避免中西医内脏概念不一致所导致的确定归经定位难的不足。
中药有效成分或有效部位与相应受体具有较强亲和力，通过激动或阻断受体而产生相应药理作用，这种亲和力的存在是中药归经理论的基础。补肾方药在给药后发挥“归经”作用，至少在骨和性腺两个靶点起作用，使骨组织中Ⅱ型胶原和骨矿化相关蛋白表达上调，ERα和ERβ mRNA表达上调，促进雌二醇、睾酮、降钙素/甲状旁腺素升高，抑制骨吸收，促进骨形成，逆转骨质疏松，增加骨密度。细辛归心经，其所含的消旋去甲乌药碱具有兴奋心肌β1受体的作用，所含的去甲猪毛菜碱具有兴奋β、α受体的作用。附子中的消旋去甲乌药碱对α、β受体都有兴奋作用，能兴奋心脏加快HR，升高血压，另一成分氧化甲基多巴胺亦有强心、升压的作用，为α-受体激动剂，这与附子归心经相符。槟榔可作用于M胆碱能受体而引起腺体分泌增加，使消化液分泌旺盛，食欲增加。从受体理论看，槟榔为M胆碱能受体激动剂，为胃肠受体接受产生兴奋作用，这与中医药理论中的槟榔归胃、大肠经是一致的。